分析：A、根據分子、原子、離子是構成物質的基本粒子進行解答；
B、根據原子核是由質子和中子構成的進行解答；
C、根據分子是由原子的構成進行解答；
D、根據化學變化的實質進行解答．
解答：解：A、構成物質的三種微粒是：分子、原子和離子，故A正確；
B、原子核是由質子和中子構成的，原子核是一種還能再分的微粒，故B錯誤；
C、分子是由原子的構成，水分子是由氫、氧原子構成的，故C正確；
D、在化學變化中，分子可以分成原子，而原子不能再分，故D正確．
故選B．
點評：通過分子、原子、離子、元素與物質之間的關系和分子、原子的構成，處理問題；了解常用物質的組成和物質的構成．
