分析：根據具有相同質子數的粒子，粒子可能為分子、原子、離子，可以通過舉反例的方法進行判斷；據此進行分析解答即可．
解答：解：A、具有相同質子數的粒子不一定具有相同的電子數，如鈉原子、鈉離子具有相同的質子數，但電子數不同，故選項說法錯誤．
B、具有相同質子數的粒子不一定是同種元素，水分子、氖原子等具有相同的質子數（均是10），但不屬于同種元素，故選項說法錯誤．
C、具有相同質子數的粒子不一定是由同種元素組成的粒子，如銨根離子（NH4+）、鈉原子的質子數（均是11），但不屬于同種元素，故選項說法錯誤．
D、具有相同質子數的粒子，可能是單質，也可能是化合物，如氖原子、水分子質子數均為10，氖氣是由一種元素組成的純凈物，屬于單質；水是由不同種元素組成的純凈物，屬于化合物；故選項說法正確．
故選D．
點評：本題考查具有相同質子數的粒子，明確常見的粒子有分子、原子、離子，利用舉例的方法判斷說法的正誤是正確解答本題的捷徑．
